Ressourcen und Links
Dienstleistungen für Forscher (FDM-Lösungen)
- Unterstützung bei der Verwaltung, Sicherung und Weitergabe von Daten.
- Persönliche Beratung zu Organisation, Compliance und Empfehlungen für ein effektives Forschungsdatenmanagement.
Beurteilung des Bedarfs
FDM Umfrage für die Beurteilung des Bedarfs
Datenmanagementpläne
- Hilfe mit der Erstellung eines Datenmanagementplans, z.B. NFDI-Plants
- Anforderungen des Geldgebers für die Datenveröffentlichung
- Eine frühzeitige Einbindung wird für projektspezifische Lösungen empfohlen.
- FDM Checkliste
Tools zum Erstellen von Metadaten und zur Entwicklung von Metadatenstandards
- Metadatenstandards Katalog
- Best-Practice-Leitfaden für Metadaten
- Metadaten-Generator
- CodeMeta-Generator
Forschungsdokumentation
Für eine transparente und nachvollziehbare Forschungsdokumentation stehen am Rechenzentrum Würzburg Elektronische Laborbücher(ELNs) wie eLabFTW und Labfolder zur Verfügung.
Speicherung von Forschungsdaten
Cloud-Speicherlösungen für kollaboratives Arbeiten und Datenaustausch
- bwSync&Share und das Rechenzentrum Würzburg (Leitfaden zur Anmeldung)
- European Open Science Cloud (EOSC)
- Bavarian Cloud for Health Research
- Individuelle Lösungen wie die TR240- und die DECIDE-Cloud
Cloud-basierte FDM-Software
- Charité Virtual Research Environment (GDPR-konform)
- Aruna Cloud ist ein ausgefeiltes Metadatenmanagement nach FAIR
- Neo4j AuraDB
- Nextcloud
- OMERO, eine Forschungsumgebung für Bildgebung
- SODAR, eine Forschungsumgebung für Sequenzierung
Hochleistungsrechner
- Julia Cluster vom Rechenzentrum Würzburg
- de.NBI cloud
- European Open Science Cloud (EOSC)
Veröffentlichung und Archivierung von Forschungsdaten
- WueData ist das institutionelle Forschungsdatenrepositorium der Julius-Maximilians-Universität Würzburg zur Veröffentlichung von Daten nach FAIR-Prinzipien.
- Der Archiveserver der Julius-Maximilians-Universität Würzburg wird für die Langzeitspeicherung von nicht aktiv in der Forschung genutzten Daten benutzt.
Wissenschaftsdaten-Repositorien
- Die Research Collaboratory for Structural Bioinformatics - Protein Data Bank (RCSB PDB) ist auf 3D-Strukturdaten großer Biomoleküle wie Proteine und Nukleinsäuren spezialisiert.
- Der Gene Expression Omnibus (GEO) fungiert als öffentliches Repositorium für Hochdurchsatz-Genexpressionsdaten sowie andere Arten von Daten zur molekularen Quantität.
- PROSITE bietet eine Datenbank mit Proteinfamilien, -Domänen und funktionellen Stellen und erleichtert so das Verständnis der Proteinfunktion und die Identifizierung signifikanter Muster.
- Die Image Data Resource (IDR) konzentriert sich auf Bilddaten und dient als Ressource für die Speicherung, Integration und Analyse von Mikroskopiedaten in wissenschaftlichen und biomedizinischen Forschungsbereichen.
Veröffentlichung von Code
- GitHub ist eine weit verbreitete Plattform zum Hosten und Teilen von Code-Repositorien. Es unterstützt die Zusammenarbeit, indem es Änderungen im Quellcode mithilfe von Git. Es ist ideal für Open-Source-Projekte.
- Ähnlich wie GitHub bietet GitLab einen webbasierten Git-Repositorium-Manager mit Wiki-, Issue-Tracking- und CI/CD-Pipeline-Funktionen, der eine umfassende Projektverwaltung und Codefreigabe ermöglicht.
- Bitbucket ist ein Git-Repositorium-Hosting-Dienst, der kostenlose Konten mit unbegrenztem privatem Repositorium für kleine Teams anbietet, was ihn zu einer guten Option für private oder kleine Projekte macht.
- SourceForge ist ein webbasierter Dienst, der Softwareentwicklern einen zentralen Online-Standort zur Verwaltung und Steuerung kostenloser, open-source Softwareprojekte bietet.
Allgemeine Anwendungen
Zenodo ist ein universelles Open-Access-Repositorium, das im Rahmen des europäischen OpenAIRE-Programms entwickelt wurde. Es ermöglicht Forschern beliebige Forschungsdaten in jeder Größe, jedem Format und aus jeder Disziplin zu teilen und aufzubewahren.